随着安东尼（Antony）的失败，元老院将意大利北部军团的指挥权分配给德基穆斯（decimus）。
盖乌斯·庞培·马格努斯（pompey magnus）的儿子塞克斯图斯·庞培（Sextus pompey）被授予共和国舰队的指挥权，他以西西里（Sicily）为基地，而布鲁图斯（brutus）和卡西乌斯（cassius）则分别被任命为马其顿（macedonia）和叙利亚（Syria）的总督。
这些任命旨在恢复“共和”事业。
然而，由凯撒老兵组成的八个军团拒绝效忠于杀害凯撒的德基穆斯，使屋大维（octavian）得以保留他的指挥权。同时，安东尼通过与被任命为外高卢（transalpine Gaul）和近西班牙（Nearer Spain）总督的马库斯·埃米利乌斯·李必达（marcus Aemilius Lepidus）联合，恢复了自己的地位。
安东尼派李必达前往罗马以调解双方关系。
尽管李必达是一个坚定的凯撒派，他仍与元老院和塞克斯图斯·庞培保持了友好关系。
然而，他的军团迅速转向支持安东尼，使安东尼掌握了17个军团，成为西部地区最大的军事力量。
到公元前43年5月中旬，屋大维开始秘密谈判，试图与安东尼结盟，以团结凯撒派对抗刺客派（liberatores）。
留在内高卢（cisalpine Gaul）的屋大维于同年7月派遣使者前往罗马，要求他被任命为接替希尔提乌斯（hirtius）和潘萨（pansa）的执政官，并要求元老院撤销将安东尼定为国家公敌的决议。
当元老院拒绝时，屋大维带领他的八个军团向罗马进军，并于公元前43年8月占领了这座城市。
随后，屋大维通过非常规方式与一位堂兄一同当选为执政官，奖赏了他的士兵，并开始追究凯撒谋杀者的罪行。
根据《佩迪亚法案》（lex pedia），所有阴谋者和塞克斯图斯·庞培被“缺席审判”定罪，并宣布为国家公敌。
之后，在李必达的倡议下，屋大维前往内高卢会见安东尼。
公元前43年11月，屋大维、李必达和安东尼在波诺尼亚（bononia）附近会面。
经过两天的讨论，这三人同意建立一个三人专政政府，统治共和国五年，现代历史学家称其为“第二次三巨头同盟”（Second triumvirate）。
他们将共和国的军队和行省分配在三人之间：安东尼掌管高卢（Gaul），李必达掌管西班牙（Spain），而作为初级伙伴的屋大维负责非洲（Africa）。
他们共同统治意大利。
这一三巨头同盟需要征服罗马的其他领地，因为布鲁图斯和卡西乌斯控制着地中海东部，而塞克斯图斯·庞培控制着地中海的岛屿。
在公元前43年11月27日，这一三巨头同盟通过新的法律《提提亚法案》（lex titia）正式成立。
为了巩固同盟关系，屋大维还与安东尼的继女克劳迪娅（claudia）结婚。
三巨头同盟的首要目标是为凯撒之死复仇，并对其谋杀者发动战争。
在向东对布鲁图斯和卡西乌斯进军之前，三巨头同盟对罗马的敌人发布了清洗令（proscription）。
公元前82年，独裁者卢修斯·科尔内利乌斯·苏拉（Lucius cornelius Sulla）曾采取类似措施清洗他的反对者。
被清洗者的名字被公布在公开名单上，他们被剥夺公民权并宣布为非法分子。
国家没收他们的财富和财产，并为逮捕或杀害他们的人提供奖励。
在这样的激励下，清洗造成了惨烈的结果：共有2000名骑士（equites）和三分之一的元老被处决。
安东尼迫使屋大维交出西塞罗（cicero），尽管他是屋大维的朋友，却是安东尼的个人敌人。
西塞罗于12月7日被杀。
这次没收行动帮助补充了凯撒内战期间耗尽的国家金库。
然而，当这些资金不足以支持即将对布鲁图斯和卡西乌斯发动的战争时，三头同盟对富人征收了新税。
到公元前42年1月，清洗结束，仅持续了两个月，尽管比苏拉时期的清洗更少流血，但它给罗马社会带来了巨大的创伤。
被点名通缉的人中，有一些逃往西西里的塞克斯图斯·庞培，或者前往东方投奔布鲁图斯和卡西乌斯。
发誓效忠三头同盟的元老被允许保留他们的职位。
公元前42年1月1日，元老院正式将凯撒封为神，称为“神圣的尤利乌斯”（the divine Julius），并确认了安东尼作为其大祭司的地位。
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由于三巨头同盟内部的争斗，布鲁图斯（brutus）和卡修斯（cassius）已经控制了罗马东部的大部分领土，并聚集了庞大的军队。
在三头同盟军能够跨越亚得里亚海进军希腊之前，他们首先必须应对塞克斯图斯·庞培（Sextus pompey）及其舰队带来的威胁。
塞克斯图斯从西西里岛的基地出发，袭击了意大利沿海，并对三头同盟进行封锁。
屋大维（octavian）的朋友兼海军上将昆图斯·萨尔维迪乌斯·鲁弗斯（quintus Salvidienus Rufus）挫败了塞克斯图斯对意大利南部雷吉乌姆（Rhegium）的进攻，但由于其舰员经验不足，萨尔维迪乌斯最终在随后的海战中败北。
直到安东尼带着舰队到来，封锁才被打破。
尽管封锁被击败，西西里岛仍然由塞克斯图斯控制，但打败“自由者”（liberatores）是三头同盟的首要任务。
公元前42年夏，屋大维和安东尼带领19个军团（几乎是他们全部的军队）出航前往马其顿（macedonia），准备与“自由者”作战，留下马库斯·李必达（marcus Lepidus）管理罗马。
与此同时，“自由者”也拥有19个军团。
然而，他们的军团并未达到满编，而屋大维和安东尼的军团则保持了满编状态。
虽然三巨头同盟的步兵更多，但“自由者”的骑兵数量更为庞大。
控制马其顿的“自由者”并不希望进行决战，而是打算占据有利防御位置，然后利用他们的海军优势切断三巨头同盟与意大利供给基地的联系。
他们此前几个月在希腊城市进行掠夺，积累了战争资金，并在色雷斯（thrace）集结了来自东部省份的罗马军团和罗马附属国的征兵。
布鲁图斯和卡修斯占据了菲利比（philippi）城西的埃涅提亚大道（via Egnatia）两侧的高地阵地。
南面的位置紧邻一片据说无法穿越的沼泽，而北面则被险峻的山丘所围挡。
他们有充足的时间加固阵地，修建了城垣和壕沟。
布鲁图斯将营地设在北侧，而卡修斯则驻扎在南侧。
安东尼很快抵达，并将军队布置在埃涅提亚大道南侧，而屋大维则将军团布置在大道北侧。
安东尼多次提出挑战，但“自由者”并不打算离开他们的防御阵地。
于是，安东尼试图秘密绕过布鲁图斯和卡修斯的阵地，从南方的沼泽地区进行侧翼进攻。
这引发了公元前42年10月3日的一场激烈战斗。
由于屋大维当天生病，安东尼指挥了三头同盟的军队，亲自指挥右翼与卡修斯对阵。
由于健康原因，屋大维留在营地，由他的副将指挥左翼与布鲁图斯对抗。
在随后的第一次菲利比战役中，安东尼打败了卡修斯并占领了其营地，而布鲁图斯则突破了屋大维的军队，进入了三头同盟的营地，但未能捕捉到生病的屋大维。
虽然这场战斗战术上打成平手，但由于通讯不畅，卡修斯误以为自己彻底失败，并自杀以免被俘。
布鲁图斯接管了军队的指挥，并更倾向于采用消耗战，而非进行正面冲突。
然而，他的军官们对这种防御战术感到不满，且他的凯撒（caesar）老兵威胁要叛变，迫使布鲁图斯在公元前10月23日举行第二次菲利比战役。
虽然最初战况均衡，但安东尼的指挥最终打败了布鲁图斯的军队。
布鲁图斯在战败后的第二天自杀，剩余的军队宣誓效忠三巨头同盟。
在这两场战斗中，超过五万名罗马士兵丧生。虽然安东尼对战败者处理宽容，但屋大维对俘虏非常残酷，甚至将布鲁图斯的尸体斩首。
菲利比战役结束了内战，三巨头同盟最终取得了胜利。
随着布鲁图斯和卡修斯的失败，只有塞克斯图斯·庞培和他的舰队依然是三巨头同盟在罗马世界的主要挑战者。
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